有兩種類型，一是光學顯微鏡觀察到的顯微結構，二是電子顯微鏡觀察到的亞顯微結構。

　　光學顯微鏡由于受放大倍數和分辨率的限制，觀察到細胞中的結構比較局限，可以看到 細胞核、葉綠體、液泡等較大的結構的基本形態(tài)。

　　電子顯微鏡可以觀察到更加細致的結構，如線粒體等細胞器的內部結構，細胞膜的大體結構等方面。